反渗透膜污染的原因主要包括物理污染、化学污染、有机物污染三大类。物理污染是原（废、污）水中的金属（如铁、锰等金属氧化物）、非金属（如CaCO3、CaSO4、BaSO4等溶解度较小的非金属盐类）、胶体污染物（如氧化硅等）在膜外表的堆积、阻塞膜孔：化学污染是指膜孔吸附的有害化学成分；有机污染物是由细菌粘泥、霉菌、有机物等在膜外表及膜孔内粘附形成的污染。能够引起反渗透膜污染的物质中污染物尤其是有机物在膜外表和膜孔内的吸附所引起的通量衰减及分离能力的降低，足形成膜通量衰减的主要原因。但膜污染引起的通量衰减又往往和浓差极化现象引起的可逆通量降低混合在一起，使得膜分离作用进一步下降。

　　反渗透设备的污染物分类：一、悬浮固体

　　悬浮固体污染物遍及存在于地表水和废水的水源中，其颗粒直径往往大于1微米。这类杂质在水流处于未搅动状况时，完全能够堆积下来，它很容易被反渗透设备设置的细砂过滤器和多介质过滤器滤出，当反渗透设备预处理系统中设置絮凝剂或凝聚剂的投加工艺时，该类杂质也能够被絮凝剂所结成的矾花吸附，之后被多介质过滤器细或砂过滤器滤出。

　　二、胶体污染物

　　胶体污染物也遍及存在于地表水和废水的水源之中，其颗粒直径往往小于1微米，这类杂质即使在未处于水流搅动时也不会自在沉降，会一直保持在悬浮状况。此类杂质可能是有机或无机成分组成的单体化合物，也可能是多类化合物组成的复合化合物。如硅酸化合物，铁铝氧化物，硫化物，单宁酸，腐殖质等等。

　　三、生物污染物

　　生物污染物也同样多存在于地表水或废水中。在处理这类水源时，污染产生时开始往往反映在反渗透设备前端的膜元件上，在此类现象产生时，反渗透设备前段压力升高较快，反渗透设备的脱盐率还会因此而有所提高，但随着膜系统的继续运行，生物污染将逐步向整个反渗透设备扩散，然后形成大面积的膜污染。膜系统出现生物污堵时，导致系统运行压力大幅度上升和产水量降低。